アミノ酸とタンパク質は、ミネラルの世界から生物への移行の中間体です。
その名前が示すように、アミノ酸は二官能性有機物質です。アミノ官能基(-NH2)とカルボキシル官能基(-COOH)で構成されています。それらは、カルボキシ基に対してアミノ基が占める位置に応じて、α、β、γなどである可能性があります。
生物学的に重要なアミノ酸はすべてα-アミノ酸です。
タンパク質の構造は20個のアミノ酸で構成されています。
上に示した一般的な構造からわかるように、アミノ酸はすべて共通の部分とそれらを特徴付ける異なる部分を持っています(一般的にRで表されます)。
20個のアミノ酸のうち、19個は光学活性です(偏光面を偏向させます)。
ほとんどのアミノ酸は1つのアミノ基と1つのカルボキシルしか持たないため、これらは 中性アミノ酸;余分なカルボキシルを持っているものは呼ばれます 酸性アミノ酸 余分なアミノ基を持つものは 塩基性アミノ酸.
アミノ酸は結晶性の固体であり、水溶性が良好です。
食事にいくつかのアミノ酸が不足していると、発達に深刻な変化が生じます。実際、人体は正確に必須と呼ばれるいくつかのアミノ酸を合成することができません(それらは食事と一緒に導入する必要があります)が、それ自体ではいくつかのアミノ酸(必須ではないもの)しか生成できません。
必須アミノ酸の不足による病気の1つは、クワシオルコル(アフリカの方言に由来する単語で「第1と第2」を意味する)という名前で知られている病気です。この病気は長子に影響を及ぼしますが、最初の子供はタンパク質の正しい供給を含む母乳が不足しているため、2番目の子供が生まれた後です。したがって、この病気は栄養不足の人々に蔓延しており、食欲不振である下痢を伴い、生物の進行性の衰弱につながります。
すでに述べたように、グリシン(R基の代わりに水素を含むα-アミノ酸であり、20の中で最も小さい)を除いて、天然アミノ酸は、少なくとも1つの不斉の存在のために光学活性を持っています炭素。天然アミノ酸では、アミノ基とカルボキシ基のみが結合している不斉炭素の絶対配置はLシリーズに属します。
D-アミノ酸がタンパク質の構造の一部になることはありません。
私たちはそれを覚えています:
DNA ----転写→m-RNA ----翻訳→タンパク質
転写はL-アミノ酸としてコーディングすることができます。 D-アミノ酸は非タンパク質構造に含まれている可能性があります(例えば、細菌の内壁:細菌には「保護的役割のためのD-アミノ酸を持つための遺伝情報はありませんが、酵素の遺伝情報はあります」バクテリアの裏打ち壁を扱う)。
アミノ酸に戻りましょう。Rグループの異なる構造は、各アミノ酸の個々の特性を定義し、タンパク質の特性に特定の貢献をします。
したがって、Rグループの性質に基づいてアミノ酸を分割すると考えられました。
極性であるが荷電していないアミノ酸:
グリシン(R = H-)
必要不可欠
セリン(R = HO-CH2-)
スレオニン
スレオニンには2つの対称中心があります。自然界には2S、3Rのスレオニンしか存在しません。
スレオニンは必須アミノ酸であるため(必須アミノ酸と混同しないでください。すべてのアミノ酸が必須です)、食事と一緒に摂取する必要があります。つまり、すでに述べたように、遺伝的遺産は人間の細胞。このアミノ酸を生産することができます(この遺産は多くの植物やより良いものに存在します)。
セリンとスレオニンのヒドロキシル基は、ホスホリル基でエステル化することができます(ホスホセリンとホスホトレオニンを取得)、このプロセスはと呼ばれます リン酸化;リン酸化は、細胞の内側と外側の間で信号を変換するために自然界で使用されます。
システイン(R = HS-CH2-)
システインのスルフヒドリルは、セリンのヒドロキシルよりもプロトン化が容易です:硫黄と酸素は両方とも6番目のグループですが、硫黄は寸法が大きいため、酸化しやすくなっています。
チロシン[R = HO-(C6H4)-CH2-]
N.B.
(C6H4)=二置換ベンゼン環
セリンやスレオニンと同様に、ヒドロキシルはエステル化(リン酸化)することができます。アスパラギン(R = NH2-CO-CH2-)
グルタミン(R = NH2-CO-CH2-CH2-)
非極性アミノ酸
疎水性の側基を有する;このクラス内で私たちは区別します:
脂肪族:
アラニン(R = CH3-)
バリン(R =(CH3)2-CH-)必須
ロイシン(R =(CH3)2-CH-CH2-)必須
イソロイシン(R =
) 必要不可欠
メチオニン(R = CH3-S-CH2-CH2-)必須
細胞膜は、疎水性のおかげでタンパク質が固定された脂質二重層で構成されているため、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシンが含まれています。一方、メチオニンは、ほとんどの場合少量(約1%)で存在するアミノ酸です。
プロリン
芳香族:
フェニルアラニン(R = Ph-CH2-)Ph =フェニル:必須の一置換ベンゼン
トリプトファン(R =
必要不可欠
これらの2つのアミノ酸は芳香族であり、近紫外線(約300 nm)を吸収します。したがって、UV分光光度法の手法を利用して、これらのアミノ酸を含む既知のタンパク質の濃度を決定することができます。
荷電アミノ酸
次に、それらは次のように分けられます。
酸性アミノ酸(pH 7で負の電荷を持つ極性残基を持つ)は、正のH +電荷を生成できるためです。
アスパラギン酸
グルタミン酸(R =
)
これらのアミノ酸は、それぞれアスパラギンとグルタミンに由来します。 4つすべてが自然界に存在し、これはc "がそれらのそれぞれに固有の情報である、つまりc"がそれらのそれぞれをコードするDNAの基本トリプレットであることを意味します。
塩基性アミノ酸(pH 7で正電荷を持つ極性残基を持つ)は、正のH +電荷を受け入れることができるためです。
リジン(R =
) 必要不可欠
アルギニン(R =
)
ヒスチジン(R =
)
側鎖にアミノ酸の誘導体が存在するタンパク質があります。たとえば、ホスホセリンが存在する場合があります(ホスホセリンをコードする遺伝情報はなく、セリンのみをコードします)。ホスホセリンは修飾です。 翻訳後:タンパク質合成が起こった後
DNA ----転写→m-RNA ----翻訳→タンパク質
このような翻訳後修飾は、タンパク質の側鎖で発生する可能性があります。
参照:タンパク質、化学の考察