ペプチド結合は、一方のカルボキシル基がもう一方のアミノ基と縮合反応（または脱水、つまり水分子の脱離につながる）によって反応するときに、2つの分子間に確立される共有結合です。 。
通常、ペプチド結合は2つのアミノ酸間で形成され、ジペプチドになります。
その分子内のジペプチドはまだアミノ基とカルボキシ基を含んでいるので、それは第3のアミノ酸とペプチド結合を形成し、トリペプチドなどを生じさせることができます。アミノ酸の数が比較的少ない場合はオリゴペプチドと呼ばれ、アミノ酸の数が多い場合はポリペプチドまたはタンパク質と呼ばれます。
実際には、図にもかかわらず、ペプチド結合は単純なタイプではなく、60％の単結合の性質と40％の二重結合の性質を持っています。
生物では、ペプチド結合の形成は、リボソームの主要なサブユニットに存在する酵素（ペプチジルトランスフェラーゼと呼ばれる）によって触媒されます。
食事に導入されるタンパク質も、ペプチド結合によって結合されたアミノ酸鎖で構成されています。消化中、これらの結合は胃液と膵液に存在する特定の酵素（ペプチダーゼ）によって切断されます。単一のアミノ酸は、腸に吸収されると血液から通過し、細胞、特に肝臓の細胞に取り込まれます。これらのアミノ酸は、新しいペプチド結合を介して結合し、必要なタンパク質（構造だけでなくホルモン、酵素）を形成します。実際、自然界には、20の通常のアミノ酸の異なる特性と、それらがポリペプチド鎖でどのように結合するかに由来する、異なる物理化学的特性を持つ多数のタンパク質があります。100のタンパク質を考えてみてください。アミノ酸は比較的小さいため、20100 = 1.27 x 10130の可能なポリペプチド鎖で構成されます。正しいアミノ酸鎖を構築するための指示は、個人のゲノムに含まれています。
